Banki nasion pozwalają przechowywać na bardzo małej przestrzeni duże ilości materiału genetycznego. Przechowywane nasiona są zabezpieczone przed niekorzystnymi zmianami siedliska, klimatu, chorobami, zjadającymi je zwierzętami i ogólnym zaniedbaniem. W pewnych przypadkach materiał z banku nasion może posłużyć do ponownego wprowadzenia do środowiska gatunków roślin, które w naturze już wyginęły. Banki nasion mają jednak również wady. Nasiona nie żyją wiecznie i trzeba je okresowo kiełkować, a otrzymane na nowo zebrać. Uprawa, zbiór i ponowne zabezpieczenie nasion jest najkosztowniejszym aspektem przechowywania materiału roślinnego w bankach nasion. Zgodnie z danymi Komisji Żywności i Rolnictwa (FAO) ONZ wiele krajów zakłada banki nasion, ale nie daje funduszy na okresową powtórną uprawę. Wielu roślin, takich jak awokado i palma kokosowa, nie można przechowywać w postaci nasion. Nie znoszą one bowiem przesuszenia, które jest niezbędne przed zamknięciem nasion w wodoszczelnych pojemnikach do przechowywania w temperaturze -18°C. Jeżeli w zamrażanym nasieniu pozostanie 20% lub więcej wody, to ono prawdopodobnie obumrze. Pewnych nasion nie można długo przechowywać, ponieważ zachowują żywotność przez krótki czas – parę miesięcy lub nawet tylko kilka dni. Zamrażanie w ciekłym azocie, tj. w temperaturze -160°C, jest nową metodą opracowaną dla niektórych nasion. Dzięki temu przeżywają one dłużej niż nasiona przechowywane w wyższej temperaturze.